眼斑水龟为水栖性,主要栖息于海拔400 米以下的丘陵地区中水流缓慢清澈、水底多为砂石的溪流中。性胆小,遇惊扰将头、尾、四肢缩入壳内或无目的地四处乱窜。喜晒太阳,适宜水温24-26℃,水质pH中性至略酸性,8-10℃活动减少,随水温降低逐渐进入冬眠。通常在山溪边或沟渠边的洞穴中冬眠。杂食性,主食小鱼虾、螺蚌、蜗牛及蠕虫等。人工饲养条件下取食猪肉、蛙、 鱼、虾、米饭、水果等。
亲龟一般4月底进行交配,5-8月份为产卵期,每年产卵分3-4批,每批产3-6枚。产卵前雌龟爬到岸上,用后肢在松软处交替掘成穴,把卵产在穴内,再扒土覆盖其卵,用腹甲将土压平,上面留1个小孔,然后离去。根据这种习性,在龟池和围墙下设长40-50厘米、宽20-30厘米的沙盘,内铺4-6厘米的细沙,盖少许阔叶植物,让其在沙盘内产卵。收集好卵,置于深8-10厘米、宽40-50厘米、长60-70厘米的孵化盘内,盖2-3厘米细沙,保持沙温25-30℃,每天洒水2次,以保持其混度。一般情况下75天即可孵出幼龟来。
由于其栖息繁殖环境破坏、减少,自然增殖困难,且有较高的经济价值,而屡遭捕捉,野生资源遭到严重破坏,处于濒危状态。
列入《中国国家重点保护野生动物名录》二级。(仅限野外种群)