四川林跳鼠属于林跳鼠亚科（Zapodidae），该亚科仅有1种：四川林跳鼠。该种有2个亚种，指名亚种发现于四川康定，腹部正中有一个“ Y”字形的暗棕色条纹；甘肃亚种发现于临潭，腹部纯白色。2个亚种的分界线大概在阿坝、马尔康、松潘、若尔盖一线的草原和森林交界区域，该区域的四川林跳鼠腹部条纹有时显著，有时不显著，在分...
