甘肃仓鼠的分类地位争议较大，有的学者将甘肃仓鼠作为独立属独立种，有的学者作为大仓鼠属（<Tscherskia>）的独立种；有的学者作为大仓鼠（<Tscherskia triton>）的亚种。最新的分类学著作（Wilson et al. 2016）作为独立属独立种。所以，其最终分类地位有待深入研究。列入《世界自然保护联盟》（IUCN）2013年濒...
