褐扁颅蝠的种类稀少,是热带型蝙蝠,多栖息于被甲虫蛀食的竹洞中。自从2008年张礼标等报道海南等3省发现该种新纪录后,张秋萍等(2014)和吴毅等(2015)又分别报道了该种在江西和广东分布新纪录,使该种在我国的分布区由原来的云南和广西2省,扩大到目前的8个省区。随着调查的深入开展,该种的分布区可能进一步扩大。 Tu et al.(2017)用分子手段,从谱系地理学角度对扁颅蝠属(<Tylonycteris>)进行了分类厘定,将原中国分布的 <T. robustula>修订为 <T. torkinensis>。
已列入中国生物多样性红色名录——脊椎动物卷,评估级别为近危NT。